第20章 基因（第1頁(yè)）

基因

這個(gè)問(wèn)題遠(yuǎn)沒(méi)有這么簡(jiǎn)單。基因組學(xué)發(fā)展到今天，圍繞它的討論和爭(zhēng)議，從結(jié)構(gòu)和功能基因組學(xué)，到生命進(jìn)化，一直到哲學(xué)，甚至到學(xué)術(shù)資源政治版圖的劃分，可以寫(xiě)上一個(gè)很有趣的故事。

存在即合理。

這個(gè)沒(méi)錯(cuò)。

但是，存在即有用嗎？譬如我們的闌尾和智齒，它們用處不大，麻煩不小，更多地是人類進(jìn)化過(guò)程中留下的遺跡，絕非什么寶貝。

人類基因組中985的非編碼序列，也要辯證地來(lái)看。

早在20世紀(jì)六七十年代，人們就開(kāi)始把非編碼序列稱為“垃圾dna”了。

然而人們很快就發(fā)現(xiàn)，不少非編碼序列跟基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控密切相關(guān)。

垃圾并不垃圾，生命也絕非僅有中心法則。

那么非編碼序列中都有些什么好東西呢？教科書(shū)中經(jīng)典的非編碼dna元件，如啟動(dòng)子和增強(qiáng)子，可動(dòng)遺傳因子，還有具有生物活性的小rna。

分子生物學(xué)發(fā)展的早期，科學(xué)家為了窺破生命這一黑箱，所設(shè)計(jì)的精妙絕倫的生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)，實(shí)在令后生拍案叫絕！

而在這高通量、大數(shù)據(jù)為王的新世紀(jì)，非編碼dna研究的主力毫無(wú)疑問(wèn)是

ende計(jì)劃。

這是全球大規(guī)模合作的科研項(xiàng)目的典范，生物大數(shù)據(jù)的先驅(qū)。

全球數(shù)十個(gè)科研團(tuán)隊(duì)，用最新開(kāi)發(fā)的高通量實(shí)驗(yàn)方法，系統(tǒng)地，全面地掃描人類和其他生物各種組織中所有非編碼dna的生物活性。

他們用的方法有chip-seq（檢測(cè)染色質(zhì)和蛋白質(zhì)的相互作用），rna-seq（把細(xì)胞里的所有rna分子作為一個(gè)整體測(cè)序），dnase-seq（把染色質(zhì)上對(duì)dna酶敏感的區(qū)域，也就是結(jié)構(gòu)較疏松較暴露的區(qū)域給測(cè)序），等等等等。

可惜當(dāng)時(shí)還沒(méi)有crispr，否則檢測(cè)基因組區(qū)域的功能（不管編碼非編碼）是非常地合適（canver

et

al，

2017）。

現(xiàn)在人們已經(jīng)開(kāi)始跟進(jìn)了。